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May 29, 2023

Die Proteinlängenverteilung ist über die Spezies hinweg konsistent

Die Proteinlängenverteilung sei im Allgemeinen über alle Arten hinweg konsistent, heißt es

Laut einer neuen Analyse in Genome Biology ist die Proteinlängenverteilung im Allgemeinen über alle Arten hinweg konsistent. Forscher der Universität Lausanne in der Schweiz und anderswo vergleichen die Längen von Proteinen von mehr als 2.300 Arten, darunter fast 1.700 Bakterien, 153 Archaeen und 485 Eukaryoten. Sie stellen fest, dass Proteine ​​aus Bakterien und Archaeen tendenziell kleiner sind (270 Aminosäuren bzw. 242 Aminosäuren) als eukaryontische Proteine, die im Durchschnitt 353 Aminosäuren lang sind. Auch die Variation der Proteinlänge ist bei Bakterien- und Archaeenarten geringer. Beim Vergleich einer Teilmenge repräsentativer Proteome stellen die Forscher jedoch fest, dass sich die Proteinlängenverteilungen der Arten überschneiden. Darüber hinaus war diese Variation in der Verteilung im Vergleich zu Variationen in anderen Merkmalen wie Genomgröße, Genlänge und Proteinzahl gering. „Die Längenverteilung von Proteinen ist bei allen Arten ein bemerkenswert konsistentes Merkmal“, schreiben sie. „Dieser Befund steht in starkem Kontrast zu anderen genomischen Merkmalen und legt nahe, dass die Proteinlänge möglicherweise einzigartigen evolutionären Einschränkungen unterliegt.“